お車はマツダのアクセラで、パワーウィンドーが一番上まで上がると、ガラスがゴム部分(ランチャンネル)からずれてしまい、水が入るほどの隙間ができてしまい、ランチャンネルの角も変形してしまいました。

ガラスを上げ下げするレギュレーターと、ランチャンネルを交換することになりました。

おそらくガラスに何らかの力がかかって、レギュレーターが変形してしまい、最後の閉まるときにずれてしまった様です。
交換したあとはきっちりしまるようになり、隙間もできずに良好になりました。